标志主要是以铜钱为基础，通过纹饰的变化创作的。圆形纹饰由波浪纹和麦穗纹样组成，分别代表着以海洋文化商业文明为主体的齐文明和以农业文明儒家文化为代表的鲁文明，二者融合，发展，博大。山东地理纹样印在正中是一种显耀。
山东博物馆徽标是由老山东文化符号——葫芦以及山东省文物保护标志——青铜鼎元素组成。葫芦象征着吉祥、丰收、富裕和福气，寓意着展示山东博物馆文物珍品和弘扬山东文化智慧的使命。青铜鼎是山东省文物保护的标志，代表着山东古代文明的辉煌和光荣。整个徽标整体呈现出简约、大气、高雅的风格，体现了山东博物馆对文化传承和文物保护的坚定信念和承诺。
山东博物馆徽标以“天圆地方，外圆内方”的理念创作。
中心图形是“山东”两字组合，东属“木”有生发之意，喻意博物馆事业生机勃勃潜力无限。
中心图案与外界连通，喻意博物馆与世界交流开放，与时俱进。
中心四个方块代表博物馆四厅。
标志红黑两色象征一阴一阳，万物负阴而抱阳，阴阳平衡的传统哲学。
