、1987/88赛季：拜仁在欧冠决赛中以1:1战平竞技米兰，最终输掉欧冠冠军。
2、1989/90赛季：拜仁在欧冠决赛中以1:0不敌AC米兰，最终无缘欧冠冠军。
3、1995/96赛季：拜仁在欧冠决赛中以2:1不敌波尔图，最终无缘欧冠冠军。
4、1997/98赛季：拜仁在欧冠决赛中以2:1不敌利物浦，最终无缘欧冠冠军。
5、1999/00赛季：拜仁在欧冠决赛中以1:2不敌巴塞罗那，最终无缘欧冠冠军。
欧冠拜仁5次获得亚军。拜仁分别是在1982年、1987年、1999年、2010年、2012年获得欧冠亚军。拜仁2022赛季欧冠爆冷出局，在与比利亚雷亚尔争夺四强名额时被其淘汰。
2020欧冠拜仁没有输，而且还夺得了冠军。本届决赛于2020年8月24日在葡萄牙里斯本的光明球场进行，对阵双方为巴黎圣日耳曼和拜仁慕尼黑。2020年8月24日，在2019-2020赛季欧洲冠军联赛决赛中，拜仁慕尼黑最终1-0力克巴黎圣日耳曼，队史上第六次登顶欧冠。
拜仁门将乌尔赖希是拜仁欧冠半决赛的“罪魁祸首”，正是他下半场刚开始的超级低级失误葬送了拜仁众将士180分钟的铁血拼搏，葬送了海因克斯老爷子的强悍精妙的战术，葬送了拜仁形式大好的翻盘机会。
2021年欧冠拜仁被大巴黎淘汰了。
2020-2021赛季欧冠足球联赛四分之一决赛次回合13日结束两场较量，两场比赛均是相同的比分—客队1:0小胜，然而晋级的都是主队。巴黎圣日耳曼淘汰了卫冕冠军拜仁慕尼黑，切尔西则将波尔图挡在了四强大门之外。
